Exploitation des bases de données publiques mondiales de séquençage haut-débit, pour étudier la prévalence des virus de vigne et de leurs variants afin d'anticiper les risques d'émergences.

La prévalence des espèces virales identifiées à ce jour chez la vigne est mal connue. Les nouvelles méthodes de séquençage haut-débit (HTS) permettent de révéler le virome associé à un échantillon et pourraient pallier ce manque de connaissance.

Les partenaires du projet proposent d’explorer les jeux de données (JDD) publiques mondiaux, libres de droit. Afin d’identifier des séquences correspondantes à des virus connus et/ou inconnus, émergents ou ré-émergents.

L’acquisition de nouvelles données sur la diversité génétique virale, en France et dans le monde, permettra d’améliorer la détection des virus et leurs variants. Ces JDD alimenteront les discussions sur les aspects réglementaires des virus de vigne au niveau français et mondial.