Diversité et interactions des communautés virales et fongiques associées aux maladies du bois de la vigne

Mots clés : réseau d'association, interactions, métagénomique virale et fongique, Botryosphaeriaceae, maladies de dépérissement

Lutter efficacement contre les dépérissements du vignoble nécessite de mieux connaître les différents facteurs impliqués, qu’ils soient génétiques, environnementaux et/ou biotiques.

Dans ce contexte, le projet Mycovir vise à explorer l’hypothèse selon laquelle la composition du virome serait une variable explicative de l’évolution du cep de vigne dans un contexte de maladies du bois. Il a pour objectif d’étudier l’impact de la diversité des communautés virales sur la composition des communautés fongiques en relation avec l’expression des symptômes.

Deux axes sont proposés :

1. l’identification des réseaux d’association des communautés mycovirales, phytovirales et fongiques favorisant ou non l’expression des symptômes ;
2. l’étude du rôle des mycovirus dans la modulation de l’agressivité des souches de Botryosphaeriaceae, champignons impliqués dans des maladies de dépérissement.

Ce projet pourra à terme proposer des indicateurs pour une gestion des communautés microbiennes afin de favoriser les interactions positives entre communautés au service de la santé de la vigne, et déboucher éventuellement sur des approches de lutte biologique innovantes.

Partenaires

Ce projet coordonné par l'Inra de Bordeaux (UMR Biologie du fruit et pathologie) regroupe l'IFV, l'UMR Save (Inra Bordeaux) et la plateforme technologique de pointe de Toulouse (Inra US GeT-PlaGe). Le lycée viticole de Rodilhan et la fédération départementale des centres d'études techniques agricoles de Sainte participent également à ce projet.

Actions

• Action 1 : Analyse spatio-temporelle de la diversité et des réseaux d'association des communautés virales et fongiques dans les ceps de vigne exprimant des symptômes de maladies du bois et des ceps sains
• Action 2 : Caractérisation des métagénomes viraux
• Action 3 : Implication des mycovirus dans la modulation de l'agressivité des Botryosphaeriaceae associés aux maladies du bois de la vigne
• Action 4 : Coordination

Calendrier

Le projet a débuté en juillet 2019 et se terminera en juin 2022.